O Conselho Nacional do Médico Interno é um órgão consultivo de competência específica da Ordem dos Médicos, composto por 18 elementos, eleito por um mandato de três anos, representativo dos Médicos Internos.

A ele cabem naturalmente responsabilidades no acompanhamento do funcionamento do Internato Médico, nomeadamente no que concerne à regulamentação e verificação de idoneidades formativas, bem como, na representação da Ordem dos Médicos junto do Conselho Nacional do Internato Médico e das Comissões Regionais do Internato Médico. Assume também um papel de provedoria, facilitando a resolução de problemas concretos dos Médicos Internos. Promove ainda a organização de atividades vocacionadas para os Médicos Internos, das quais são exemplo a Mostra de Especialidades (MOSTREM) e o Congresso Nacional do Médico Interno.